Áætlanir, sjóðir og aðrar sérstofnanir SÞ voru skipaðar af allsherjarþinginu til að vinna á sérstökum sviðum. Þær vinna í nánum tengslum við Efnahags- og félagsmálaráðið og í flestum tilvikum gefa þær skýrslu til allsherjarþingsins og ráðsins. Sérstofnanirnar eru:
- UNICEF Barnahjálp SÞ
- UNRWA Palestínuflóttamannaaðstoðin
- UNHCR Flóttamannastofnun SÞ
- WFP Matvælaáætlun SÞ
- UNITAR Mennta- og rannsóknarstofnun SÞ
- UNCTAD Ráðstefna SÞ um viðskipti og þróun
- UNDP Þróunaráætlun SÞ oft nefnd Þróunarstofnun
- UNFPA Mannfjöldasjóður SÞ
- UNEP Umhverfisstofnun SÞ
- UNU Háskóli SÞ
- UN Women Jafnréttisstofnun SÞ
- UNCHS Búsetuskrifstofa SÞ
